Drejtoria e doganave kompetencat e saja i zbaton në mbarë territorin e Republikës së Maqedonisë, ndërsa selia është në Shkup.
Duke ruajtur parimin e punës transparente, Drejtoria e doganave rregullisht publikon edhe raporte tremujore për punën e saj.
Punën e saj Drejtoria e doganave e rregullon mbështetur në më shumë dispozita ligjore dhe legjislacione.
Drejtoria e doganave e Republikës së Maqedonisë në mënyrë aktive merr pjesë në punën e të gjitha organizatave ndërkombëtare nga fusha e punës doganore: Organizata botërore e doganave (OBD), Organizata botërore tregtare (OBT), Trupat e punës së OH, SELEC dhe të tjerë.
